施用有機(jī)肥料的一點(diǎn)就是增加了土壤的有機(jī)物質(zhì)。有機(jī)質(zhì)的含量雖然只占耕層土壤總量的百分之零點(diǎn)幾百分之幾，但它是土壤的成分，是土壤肥力的首要物質(zhì)基礎(chǔ)。有機(jī)肥料對(duì)土壤的結(jié)構(gòu)、土壤中的營養(yǎng)、酶、水分、通氣和微生物活性等有影響。

有機(jī)肥料含有植物需要的大量營養(yǎng)成分，對(duì)植物的營養(yǎng)供給比較陡峭耐久，有很長的后效。有機(jī)肥料還含有多種微量元素。由于有機(jī)肥料中各種營養(yǎng)元素比較均衡。

畜禽糞便中帶有動(dòng)物消化道排泄的各種活性酶，以及微生物產(chǎn)生的各種酶。施用有機(jī)肥大大提高了土壤的酶活性，有利于提高土壤的吸收功能、緩沖功能和抗逆功能。施用有機(jī)肥料增加了土壤中的有機(jī)膠體，把土壤顆粒膠結(jié)起來，變成安穩(wěn)的團(tuán)粒結(jié)構(gòu)，改進(jìn)了土壤的物理、化學(xué)和生物特性，提高了土壤保水、保肥和透氣功能。為植物生長發(fā)明良好的土壤環(huán)境。

有機(jī)肥在土壤中分解，轉(zhuǎn)化構(gòu)成各種腐殖酸物質(zhì)。能促進(jìn)植物體內(nèi)的酶活性、物質(zhì)的組成、運(yùn)輸和堆集。腐殖酸是一種高分子物質(zhì)，陽離子代換量高，具有很好的絡(luò)合吸附功能，對(duì)重金屬離子有很好的絡(luò)合吸附效果，能有效地減輕重金屬離子對(duì)作物的毒害，并阻止其進(jìn)入植株中。