土壤分酸堿，有機(jī)菌肥也有pH值，菌分真菌和細(xì)菌。中性和微酸性土壤應(yīng)施用細(xì)菌有機(jī)菌肥。堿性土壤宜施用絲狀微生物的真菌有機(jī)菌肥，既能固定空氣中的氮，又能幫助果樹(shù)利用其他狀態(tài)存在的氮營(yíng)養(yǎng)。

其實(shí)土壤中有很多微生物，數(shù)量也非常多。它們大多對(duì)作物的生長(zhǎng)發(fā)育、土壤的團(tuán)粒結(jié)構(gòu)和物質(zhì)循環(huán)有很大的影響。還能分解有機(jī)物和礦物質(zhì)，釋放營(yíng)養(yǎng)元素供作物吸收利用。酸性土壤施堿性有機(jī)菌肥，酸堿中和降低了肥效，也損傷了菌種。有些菌是好氧菌，如放線菌、霉菌，施于透氣性差的板結(jié)土壤中，菌種本身都難以存活，更不用說(shuō)發(fā)酵繁殖了。

菌肥中菌的生存條件是有機(jī)質(zhì)。而80%以上的果園都在施用無(wú)機(jī)肥料，土壤板結(jié)，通風(fēng)不良，導(dǎo)致大量厭氧菌，如鐮刀菌等。更有甚者，有機(jī)肥的缺乏損壞了土壤的團(tuán)粒結(jié)構(gòu)，降低了土壤保肥保水的能力。果農(nóng)使用的商品有機(jī)肥一般每畝40公斤左右，有機(jī)質(zhì)很快分解利用。有機(jī)肥中的菌種沒(méi)有其生存條件就無(wú)法繁殖存活，大部分消失。這是果農(nóng)在施用商品有機(jī)肥中發(fā)現(xiàn)的道理，厚土施有機(jī)肥有效果，薄土施有機(jī)肥沒(méi)效果。

果園多年不施有機(jī)肥，淺施無(wú)機(jī)肥，導(dǎo)致土壤板結(jié)，儲(chǔ)氧差，根系生長(zhǎng)緩慢。土壤的pH值會(huì)發(fā)生變化。除草劑在土壤中的殘留直接損壞了土壤的團(tuán)粒結(jié)構(gòu)，消滅了土壤中的微生物。果園施用有機(jī)菌肥后，微生物被殘留的除草劑等物質(zhì)消滅，土壤中沒(méi)有足夠的微生物使菌肥發(fā)酵繁殖形成有效菌群，阻礙了肥效的發(fā)揮。果園正確選擇除草劑，應(yīng)能除草并在土壤中短時(shí)間殘留，對(duì)土壤微生物和土壤團(tuán)粒結(jié)構(gòu)沒(méi)有太大損壞。注意施用有機(jī)肥，改良土壤3 ~ 5年。

農(nóng)戶對(duì)這種新肥料一無(wú)所知。正確看待區(qū)域代理商和廠家的夸大宣傳，有的甚至用顯微鏡忽悠群眾，不告知自己的菌肥是什么種類的細(xì)菌，起什么作用，在什么條件下如何施用。

每種有機(jī)菌肥都有自己的特性和功能。比如球形芽孢桿菌是一種細(xì)菌殺蟲(chóng)菌，EM菌對(duì)重菌有抗性，乳狀芽孢桿菌是一種長(zhǎng)效細(xì)菌殺蟲(chóng)菌?？莶菅挎邨U菌是一種細(xì)菌，能有效防治根系周圍的細(xì)菌，保護(hù)作物不受侵害。