(1)有機(jī)肥含有大量有機(jī)質(zhì)，具有明顯的土壤改良和施肥作用；化肥只能為作物提供無(wú)機(jī)養(yǎng)分，長(zhǎng)期施用會(huì)對(duì)土壤造成不良影響，使土壤“越來(lái)越饞”。

(2)有機(jī)肥含有多種養(yǎng)分，有機(jī)肥所含養(yǎng)分均衡；而化肥所含養(yǎng)分種類單一，長(zhǎng)期施用容易導(dǎo)致土壤和食物中養(yǎng)分的不平衡。

(3)有機(jī)肥養(yǎng)分含量低，需要大量施用，而化肥養(yǎng)分含量高，施用量低。

(4)有機(jī)肥肥效時(shí)間長(zhǎng)；化肥肥效期短而猛，容易造成養(yǎng)分流失和環(huán)境污染。

(5)有機(jī)肥來(lái)源于大自然，肥料中沒(méi)有化學(xué)合成物質(zhì)。長(zhǎng)期施用可以提高農(nóng)產(chǎn)品的品質(zhì)；化肥是化學(xué)合成物質(zhì)，施用不當(dāng)會(huì)降低農(nóng)產(chǎn)品品質(zhì)。

(6)在生產(chǎn)加工過(guò)程中，有機(jī)肥充分腐熟，就能提高作物的抗旱、抗病、抗蟲(chóng)能力，減少農(nóng)藥用量。長(zhǎng)期施用化肥，往往需要大量的化學(xué)農(nóng)藥來(lái)維持作物生長(zhǎng)，容易導(dǎo)致食物中有害物質(zhì)的增加。

(7)有機(jī)肥含有有益微生物，能促進(jìn)土壤中的生物轉(zhuǎn)化過(guò)程，有助于持續(xù)提高土壤肥力；長(zhǎng)期施用化肥會(huì)控制土壤微生物的活動(dòng)，導(dǎo)致土壤自我調(diào)節(jié)能力下降。